飛凡檢測: | 細胞鑒定 |
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所在地: | 江蘇 蘇州 吳江 |
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發(fā)布時(shí)間: | 2023-12-17 11:20 |
最后更新: | 2023-12-17 11:20 |
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飛凡檢測張同學(xué)今天與大家淺聊一下STR,什么是STR呢?
STR即短串聯(lián)重復序列(Short Tandem Repeats),也稱(chēng)微衛星DNA(microsatellite DNA),是一段包含1-6bp的重復DNA序列。STR廣泛存在于原核動(dòng)物和真核動(dòng)物中,人類(lèi)中也不例外,約占人類(lèi)基因組的3%。由于其多態(tài)性和高突變率,STR在生物學(xué)研究中得到了廣泛的應用,又被稱(chēng)為細胞的DNA指紋。
由于STR技術(shù)的高靈敏度、自動(dòng)化程度高、準確快速、重復性好等優(yōu)點(diǎn),STR基因分型已被作為金標準應用于細胞鑒定,由于細胞系交叉污染或錯誤辨識而導致研究錯誤、結果不可重復等情況的存在,建議在實(shí)驗開(kāi)展前進(jìn)行細胞的STR鑒定分析。
細胞STR鑒定即通過(guò)STR信息建立細胞系的遺傳特性,通過(guò)STR鑒定來(lái)檢測細胞是否發(fā)生交叉污染或者誤認的情況。STR 基因座位上的等位基因可通過(guò)擴增區域內重復序列拷貝數的不同來(lái)區分,在毛細管電泳分離之后可通過(guò)熒光檢測來(lái)識別。隨后通過(guò)一定的計算方法,即可根據所得的STR分型結果與細胞STR數據庫比對,從而推算出樣品所屬的細胞系或可能的交叉污染的細胞系名稱(chēng)。
STR(Short Tandem Repeat,短串聯(lián)重復序列)基因位點(diǎn)由長(cháng)度為3~7個(gè)堿基對的短串連重復序列組成,這些重復序列廣泛存在于人類(lèi)基因組中,可作為高度多態(tài)性標記,被稱(chēng)為細胞的DNA指紋。 STR基因座位上的等位基因可通過(guò)PCR擴增區域內重復序列的拷貝數的不同來(lái)區分,在毛細管電泳分離之后可通過(guò)熒光檢測來(lái)識別,隨后通過(guò)一定的計算方法,即可根據所得的STR分型結果與專(zhuān)業(yè)的細胞STR數據庫比對從而推算出樣品所屬的細胞系或可能的交叉污染的細胞系名稱(chēng)。那么STR的鑒定結果能說(shuō)明什么呢? STR的鑒定結果能證明以下問(wèn)題: 1. 是否為人源細胞;2. 是否為標準細胞系;3. 是否存在物種內交叉污染。為什么要進(jìn)行STR鑒定?據統計,約18%~30%細胞系被交叉污染或錯誤辨識,使用該細胞可能導致研究錯誤、結果不可重復、臨床細胞治療災難性后果等。 2009年起,NIH和ATCC呼吁研究者對細胞進(jìn)行STR鑒定并著(zhù)手建立細胞STR數據庫。如今,細胞STR鑒定已是鑒別細胞身份及交叉污染的金標準。多數**期刊也要求作者投稿時(shí)提供細胞STR鑒定證明。《中國藥典》中明確規定,新建細胞系/株、細胞庫和生產(chǎn)終末細胞應進(jìn)行鑒別試驗,以確認為本細胞,且無(wú)其他細胞的交叉污染。