非生物生態(tài)指標：

　　―海水大腸菌群、糞大腸菌群、鹽度、溶解氧、懸浮物、pH、活性磷酸鹽、活性硅酸鹽、硝酸鹽氮、亞硝酸鹽氮、氨氮、總磷、總氮、無(wú)機磷、生化需氧量、化學(xué)需氧量、非離子態(tài)氨、油類(lèi)、葉綠素a、總汞、鎘、鉛、砷、鋅、硒、銅、鎳、總鉻、六價(jià)鉻、氰化物、硫化物、氯化物、揮發(fā)性酚、陰離子洗滌劑、油類(lèi)、多氯聯(lián)苯、六六六、滴滴涕、狄氏劑等；

　　―海洋沉積物質(zhì)量總汞、鎘、鉛、鋅、銅、鉻、砷、有機碳、硫化物、油類(lèi)、粒度、含水率、氧化還原電位、總磷、總氮、六六六、滴滴涕、狄氏劑、多氯聯(lián)苯等；

　　―海洋氣象觀(guān)測風(fēng)速、風(fēng)向、氣溫、氣壓、濕度、海況、天氣現象等；

　　―海洋水文觀(guān)測水質(zhì)、水色、透明度、色臭味監測、水深測量、水溫觀(guān)測、鹽度測量、海流觀(guān)測、海浪觀(guān)測、水位觀(guān)測、海水透明度觀(guān)測、水色觀(guān)測等。

　　●生物生態(tài)指標：

　　―浮游生物浮游植物的種類(lèi)組成、數量分布、密度、優(yōu)勢種及多樣性指數；浮游動(dòng)物的生物量、種類(lèi)組成、密度、數量分布、總生物量（濕重）、優(yōu)勢種及多樣性指數。

　　―大型底棲生物大型底棲生物種類(lèi)組成、棲息密度、生物量、優(yōu)勢種及多樣性指數。

　　―淺海底棲生物淺海底棲生物種類(lèi)組成、棲息密度、生物量、優(yōu)勢種及多樣性指數。

　　―潮間帶生物高中低潮間帶底棲生物的種類(lèi)組成、密度、生物量、優(yōu)勢種、各潮區分布及多樣性指數。

　　―微生物細菌總數、異養細菌總數、總大腸菌群數量、糞大腸菌群數量、弧菌數量

　　―初級生產(chǎn)力葉綠素a及初級生產(chǎn)力。

　　―漁業(yè)資源（魚(yú)卵與仔稚魚(yú)）魚(yú)卵仔稚魚(yú)的種類(lèi)組成、密度、數量分布。

　　―游泳動(dòng)物游泳動(dòng)物的種類(lèi)組成、資源密度；魚(yú)類(lèi)、蝦類(lèi)、蟹類(lèi)、頭足類(lèi)等各門(mén)類(lèi)的種類(lèi)組成和資源密度；游泳動(dòng)物相對重要性指數、優(yōu)勢種及多樣性指數；主要經(jīng)濟種類(lèi)生物學(xué)特性、幼體比例等。

　　―海洋生物質(zhì)量海洋生物體內重金屬（鉛、鎘、鋅、總汞、銅、鉻、砷、硒）、石油烴、農藥殘留（六六六、滴滴涕、狄氏劑）、多氯聯(lián)苯、麻痹性貝類(lèi)毒素等。

　　●入海排污口監測指標：

　　入海排污口監測指標包括流量指標和污水中的污染物（或污染指標）瞬時(shí)濃度，應記錄色嗅味等感觀(guān)描述、拍攝記錄監測排污口的環(huán)境狀況。

　　―城鎮生活污水排口/工業(yè)排口/農業(yè)農村排口/河渠、雨洪及其他類(lèi)型排口流量、pH、鹽度、COD、氨氮、總氮、總磷、BOD5、TOC、懸浮物、油類(lèi)、重金屬、氰化物、揮發(fā)酚、硫化物、多環(huán)芳烴、多氯聯(lián)苯、揮發(fā)性有機物、揮發(fā)性鹵代烴、糞大腸菌群、污水生物毒性（發(fā)光細菌法）、重金屬（Hg、Cr、Cr(VI)、Cu、Pb、Zn、Cd和Ni等）。